この規格 プレビューページの目次
※一部、英文及び仏文を自動翻訳した日本語訳を使用しています。
1 スコープ
このドキュメントは、データベース スキーマの変更を強制することなく、世界中のオミクス データの交換を容易にするように設計されたデータ交換フォーマットに適用できます。
このドキュメントでは、OML の特性を次の観点から規定します。
情報学の観点から、OML は XML に基づいてデータ交換フォーマットを定義します。このドキュメントは、データ交換フォーマットの仕様に関するガイドラインを示していますが、このドキュメントではデータベース スキーマ自体は除外しています。
分子の観点から、このドキュメントはあらゆる種類のオミクス データに適用できますが、このドキュメントでは分子の詳細 (たとえば、ゲノム シーケンスのバリエーションや全ゲノム シーケンスの詳細) は除外されています。このドキュメントは、臨床上の問題や他のオミクスの問題との関係を含む分子アノテーションにも適用できます。
アプリケーションの観点から、このドキュメントは、臨床診療、予防医学、トランスレーショナルリサーチ、および臨床創薬を含む臨床研究を含む臨床分野に適用できます。このドキュメントは、基礎研究やその他の科学分野には適用されません。
生物種の観点から、この文書はヒト、前臨床動物、および細胞株などのヒトの健康に関連する種に適用できます。このドキュメントは、他の生物種には適用されません。
1 Scope
This document is applicable to the data exchange format that is designed to facilitate exchanging omics data around the world without forcing changes of any database schema.
This document specifies the characteristics of OML from the following perspectives.
From an informatics perspective, OML defines the data exchange format based on XML. This document gives guidelines for the specifications of the data exchange format, but this document excludes the database schema itself.
From a molecular side of view, this document is applicable to all kinds of omics data, while this document excludes the details of the molecules (e.g., details of genomic sequence variations or whole genomic sequence). This document is also applicable to the molecular annotations including clinical concerns and relations with other omics concerns.
From an application side of view, this document is applicable to the clinical field including clinical practice, preventive medicine, translational research, and clinical research including drug discovery. This document does not apply to basic research and other scientific fields.
From a biological species side of view, this document is applicable to the human health-associated species as human, preclinical animals, and cell lines. This document does not apply to the other biological species.