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※一部、英文及び仏文を自動翻訳した日本語訳を使用しています。
序章
この文書は、陸生動物フィールド メソッドの標準化の必要性が高まっているため作成されました。このような方法は、主に土壌無脊椎動物のサンプリング、抽出、および取り扱いを対象としており、次の目的のために必要です。
- 土壌品質評価を含む土壌の生物学的分類[ 37],[42],[57] ;
- 陸生生物指標と長期モニタリング[ 25],[28],[31],[50] ;
- 野外の土壌動物に対する化学物質の影響の評価 (ISO 11268-3 [ 4] を参照)
これらの目的のためのデータは、標準化された方法によって取得されます。これは、広範な決定 (たとえば、特定のサイトを修復する必要があるかどうかなど) の基礎を形成できるためです。実際、そのような標準化された方法の欠如は、陸上（すなわち土壌）生息地における生物分類および生物評価がこれまで水生サイトと比較してほとんど使用されていない最も重要な理由の 1 つです。
線虫は、土壌動物相の重要かつ主要な部分です。一部の著者は、このグループがおそらく地球上の多細胞生物 (後生動物) の中で最も優勢な生物であると推定しています[ 52] 。線虫は、南極から熱帯、深海の堆積物から山岳地帯に生息しています。十分な水と有機物があれば、あらゆる場所で活動します。種の多様性と機能の多様性は印象的です[ 14] 。線虫は一般に動植物の寄生虫として知られていますが、線虫動物の大部分はバクテリアや菌類を食べて分解プロセスに参加しています。
線虫は、ほぼすべての土壌サンプルに多数 (0.2 × 10 6 m -2から 9 × 10 6 m -2 ) 存在し、高い多様性 (10 から 100 種) を持っています[ 12] 。さらに、細菌食動物、真菌食動物、草食動物、捕食者、雑食動物などの線虫の間には、摂食タイプと食物網の関係の広い生態学的スペクトルがあります[ 57], [58] 。これらの要因により、このグループは生態学的な土壌品質の指標として非常に適しています[ 56] が、結果の比較と組み合わせのために方法の標準化が緊急に必要です。
過去 100 年間、線虫学は、農業、勧告的サンプリング、および植物検疫規制の観点から強力に発展してきました。方法に関しては、世界のさまざまな地域にいくつかの「学校」があり、それぞれの歴史、実際的な長所と短所があります。 Oostenbrink [ 14] と Southey [ 48], [49] によって包括的な概要が説明されています。最近記述されたメソッド (またはバリアント) は、多くの場合、特定の植物寄生種に特別な関心を持って開発されています。過去 20 年以内に、線虫種の DNA ベースの分類学的同定を可能にする新しい方法が進化しました[ 21], [34], [54これは、線虫の分類学的分析を非専門家のより広いコミュニティに開放します。
Bongers [ 16] が成熟指数を導入して以来、土壌品質の生物指標における線虫の使用が急速に増加しています[ 56] 。線虫は現在、世界中のいくつかの国で生態学的土壌研究と監視に使用されています。モニタリング活動では、方法論に特別な要求が課せられます。たとえば、合理的なコストに対して大量の土壌サンプルを日常的に処理する必要があります。もともと農業の助言サンプリング用に開発された方法のいくつかは、生態学的研究に非常に適しています。これらは、このドキュメントで説明する特定のバリアントの基礎を形成します。
提案された手順によって特徴付けられる線虫は、土壌に見られる線虫のすべての自由生活形態です。それらには、非植物摂食線虫だけでなく、外部寄生植物摂食線虫および内部寄生線虫の自由生活期が含まれます。根の偏性植物摂食線虫の定量化には、特定の方法が必要です。線虫の生態と生物指標としての使用に関する基本的な情報は、参考文献に記載されています。
Introduction
This document has been drawn up since there is a growing need for the standardization of terrestrial zoological field methods. Such methods, mainly covering the sampling, extraction and handling of soil invertebrates, are necessary for the following purposes:
- biological classification of soils including soil quality assessment [37],[42],[57];
- terrestrial bio-indication and long-term monitoring [25],[28],[31],[50];
- evaluation of the effects of chemicals on soil animals in the field (see ISO 11268-3 [4]).
Data for these purposes are gained by standardized methods since they can form the basis for far-reaching decisions (e.g. whether a given site should be remediated or not). In fact, the lack of such standardized methods is one of the most important reasons why bio-classification and bio-assessment in terrestrial (i.e. soil) habitats has so far been relatively rarely used in comparison to aquatic sites.
Nematodes are an important and major part of the soil fauna. Some authors estimate that this group is probably the most dominant one of the multicellular organisms (Metazoa) on earth[52]. Nematodes occur from the Antarctic to the tropics and from deep sea sediments to mountain regions. They are active in every place with sufficient water and organic material. The species diversity and functional variety are impressive[14]. Nematodes are commonly known as parasites of animals and plants, but the major part of the nematode fauna participates in decomposition processes by feeding on bacteria and fungi.
Nematodes occur in high numbers (0,2 × 106 m-2 to 9 × 106 m-2) and with a high (10 to 100 species) diversity in almost every soil sample[12]. Moreover, there is a broad ecological spectrum of feeding types and food web relations among the nematodes such as bacterivores, fungivores, herbivores, predators and omnivores[57],[58]. These factors make the group highly suitable as indicators for ecological soil quality[56], but standardization of methods is urgently needed for comparison and combination of results.
In the past 100 years, nematology has developed strongly from the viewpoint of agriculture, advisory sampling and phytosanitary regulations because some terrestrial nematodes cause a lot of damage in crops. With respect to methods, there are several “schools” in different parts of the world with their own history, practical advantages and disadvantages. A comprehensive overview is given by Oostenbrink[14] and Southey[48],[49]. The more recently described methods (or variants) are often developed with special interest to certain plant parasitic species. Within the past 20 years new methods have evolved that allow a DNA-based taxonomic identification of nematode species[21],[34],[54]. This opens the taxonomic analysis of nematodes to a broader community of non-specialists.
Since Bongers[16] introduced the Maturity Index, the use of nematodes in bio-indication for soil quality has increased rapidly[56]. Nematodes are now used for ecological soil research and monitoring in several countries all over the world. Monitoring activities make special demands on methodology, for instance, that a large number of soil samples is processed on a routine basis against reasonable costs. Some of the methods originally developed for advisory sampling in agriculture are very suitable for ecological research. They form the basis for specific variants described in this document.
The nematodes that are characterized by the proposed procedure are all the free-living forms of nematodes found in soil. They include non-plant-feeding nematodes as well as ectoparasitic plant-feeding nematodes and free-living stage of endoparasitic nematodes. The quantification of obligate plant-feeding nematodes in roots requires specific methods. Basic information on the ecology of nematodes and their use as bio-indicators can be found in the bibliography.