※一部、英文及び仏文を自動翻訳した日本語訳を使用しています。
序文
ISO (国際標準化機構) は、各国の標準化団体 (ISO メンバー団体) の世界的な連合です。国際規格の作成作業は、通常、ISO 技術委員会を通じて行われます。技術委員会が設立された主題に関心のある各会員団体は、その委員会に代表される権利を有します。 ISOと連携して、政府および非政府の国際機関もこの作業に参加しています。 ISO は、電気技術の標準化に関するすべての問題について、国際電気標準会議 (IEC) と緊密に協力しています。
この文書の開発に使用された手順と、今後の維持のために意図された手順は、ISO/IEC 指令で説明されています。 1. 特に、さまざまなタイプの ISO 文書に必要なさまざまな承認基準に注意する必要があります。この文書は、ISO/IEC 指令の編集規則に従って作成されました。 2 ( www.iso.org/directives を参照)
このドキュメントの要素の一部が特許権の対象となる可能性があることに注意してください。 ISO は、そのような特許権の一部または全部を特定する責任を負わないものとします。ドキュメントの開発中に特定された特許権の詳細は、序文および/または受信した特許宣言の ISO リストに記載されます ( www.iso.org/patents を参照)
このドキュメントで使用されている商号は、ユーザーの便宜のために提供された情報であり、保証を構成するものではありません。
規格の自主的な性質の説明、適合性評価に関連する ISO 固有の用語と表現の意味、および技術的貿易障壁 (TBT) における世界貿易機関 (WTO) の原則への ISO の準拠に関する情報については、以下を参照してください。 www.iso.org/iso/foreword.html .
この文書は、技術委員会 ISO/TC 34, 食品、小委員会 SC 16, 分子バイオマーカー分析のための水平的方法によって作成されました。
ISO 21569 シリーズのすべての部品のリストは、ISO Web サイトにあります。
1 スコープ
この文書は、カリフラワー モザイク ウイルス (CaMV) からオープン リーディング フレーム , またはその両方について陽性の PCR 結果をさらに明確にするために、遺伝子組み換え作物/植物およびそれらの派生製品のスクリーニングのコンテキストで使用できます。 nos遺伝子 (P- nos 、T- nos )、それぞれ。
このドキュメントで指定されている方法は、指定された標的配列を含む遺伝子組み換え植物イベントの非存在下でサンプルに存在する場合、天然の CaMV またはリゾビウム ラジオバクター(Ti プラスミド) DNA, またはその両方を検出および識別します。
どちらの方法もリアルタイムのポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) に基づいており、食品や飼料、種子/穀物などの他の製品から抽出された DNA の分析に適用できます。メソッドの適用には、関連するマトリックスから十分な量の増幅可能な DNA を抽出する必要があります。
適切なキャリブレーション材料を使用して、CaMV ORF V またはnosコピー数、またはその両方をそれぞれ推定し、プロモーター (P-35S, P- nos ) またはターミネーター (T-35S, T-35S) の推定コピー数と比較することができます。 T- nos ) シーケンス、またはその両方。これにより、検出された CaMV DNA またはリゾビウム ラジオバクターTi プラスミド DNA, またはその両方に加えて、未知の遺伝子組み換え生物 (GMO) の存在について結論を出すことができます。
2 参考文献
以下のドキュメントは、その内容の一部またはすべてがこのドキュメントの要件を構成するように、本文で参照されています。日付のある参考文献については、引用された版のみが適用されます。日付のない参照については、参照文書の最新版 (修正を含む) が適用されます。
- ISO 16577, 分子バイオマーカー分析 — 農業および食品生産における分子バイオマーカー分析方法の語彙
- ISO 21569:2005, 食品 — 遺伝子組み換え生物および派生製品の検出のための分析方法 — 定性的核酸ベースの方法
- ISO 21571, 食品 — 遺伝子組み換え生物および派生製品の検出のための分析方法 — 核酸抽出
- ISO 24276, 食品 - 遺伝子組み換え生物および派生製品の検出のための分析方法 - 一般要件および定義
3 用語と定義
このドキュメントの目的のために、ISO 16577 に記載されている用語と定義が適用されます。
ISO および IEC は、次のアドレスで標準化に使用する用語データベースを維持しています。
参考文献
| [1] | Weller SA, Simpkins SA, Stead DE, Kurdziel A, Hird H, Weekes RJアグロバクテリウム属の同定。 TaqMan PCR によるセイヨウアブラナ種子内に存在 – GM スクリーニング手順への影響。 Arch.Microbiol 。 2002, 178, pp. 338-343 |
| [2] | Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ 基本的なローカル アラインメント検索ツール。 J.Mol.Biol . 1990, 215, pp. 403-410 |
| [3] | Schuler, DG 電子 PCR による配列マッピング。ゲノム解像度。 1997, 7, pp. 541-50 |
| [4] | Rotmistrovsky, K., Jang, W., Schuler, GD 電子 PCR を実行するための Web サーバー。核酸解像度。 2004年、32 pp.108–12 |
| [5] | Uhlig, S., Frost, K., Colson, B., Simon, K., Mäde, D., Reiting, R., Gowik, P., Grohmann, L.検出確率の統計モデリング。認定。 Qual.Assur . 2015, 20, pp. 75–83 |
| [6] | ISO 5725-2, 測定方法と結果の正確さ (真実性と精度) — 2：標準的な測定方法の再現性と再現性を決定するための基本的な方法 |
Foreword
ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical committee has been established has the right to be represented on that committee. International organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work. ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of electrotechnical standardization.
The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are described in the ISO/IEC Directives, 1. In particular, the different approval criteria needed for the different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the editorial rules of the ISO/IEC Directives, 2 (see www.iso.org/directives ).
Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or on the ISO list of patent declarations received (see www.iso.org/patents ).
Any trade name used in this document is information given for the convenience of users and does not constitute an endorsement.
For an explanation of the voluntary nature of standards, the meaning of ISO specific terms and expressions related to conformity assessment, as well as information about ISO’s adherence to the World Trade Organization (WTO) principles in the Technical Barriers to Trade (TBT), see www.iso.org/iso/foreword.html .
This document was prepared by Technical Committee ISO/TC 34, Food products, Subcommittee SC 16, Horizontal methods for molecular biomarker analysis.
A list of all parts in the ISO 21569 series can be found on the ISO website.
1 Scope
This document specifies a procedure for the detection of a DNA sequence of the open reading frame five (ORF V) from cauliflower mosaic virus (CaMV) and a procedure for the detection of the DNA sequence of the nopaline synthase (nos) gene from tumour-inducing (Ti) plasmids of phytopathogenic Rhizobium radiobacter (formerly named Agrobacterium tumefaciens). The procedures can be used in the context of screening for genetically modified crop/plants and their derived products to further clarify a positive PCR result for a specific promoter or terminator of CaMV (P-35S, T-35S), or both, and the nos gene (P-nos, T-nos), respectively.
The methods specified in this document will detect and identify naturally occurring CaMV or Rhizobium radiobacter (Ti plasmid) DNA, or both, if present in the sample in the absence of a genetically modified plant event containing the specified target sequences.
Both methods are based on the real-time polymerase chain reaction (PCR) and are applicable for the analysis of DNA extracted from foodstuffs and other products such as feedstuffs and seeds/grains. The application of the methods requires the extraction of an adequate amount of amplifiable DNA from the relevant matrix.
With appropriate calibration material, the CaMV ORF V or nos copy number, or both, can be estimated and compared, respectively, with the estimated copy number for the promoter (P-35S, P-nos) or the terminator (T-35S, T-nos) sequences, or both. Thereby, conclusions are possible about the presence of an unknown genetically modified organism (GMO) in addition to any detected CaMV DNA or Rhizobium radiobacter Ti plasmid DNA, or both, in a test sample.
2 Normative references
The following documents are referred to in the text in such a way that some or all of their content constitutes requirements of this document. For dated references, only the edition cited applies. For undated references, the latest edition of the referenced document (including any amendments) applies.
- ISO 16577, Molecular biomarker analysis — Vocabulary for molecular biomarker analytical methods in agriculture and food production
- ISO 21569:2005, Foodstuffs — Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived products — Qualitative nucleic acid based methods
- ISO 21571, Foodstuffs — Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived products — Nucleic acid extraction
- ISO 24276, Foodstuffs — Methods of analysis for the detection of genetically modified organisms and derived products — General requirements and definitions
3 Terms and definitions
For the purposes of this document, the terms and definitions given in ISO 16577 apply.
ISO and IEC maintain terminology databases for use in standardization at the following addresses:
Bibliography
| [1] | Weller, S.A., Simpkins, S.A., Stead, D.E., Kurdziel, A., Hird, H., Weekes, R.J. Identification of Agrobacterium spp. present within Brassica napus seed by TaqMan PCR – Implications for GM screening procedures. Arch. Microbiol. 2002, 178, pp. 338–343 |
| [2] | Altschul, S.F., Gish, W., Miller, W., Myers, E.W., Lipman, D.J. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 1990, 215, pp. 403–410 |
| [3] | Schuler, G.D. Sequence mapping by electronic PCR. Genome Res. 1997, 7, pp. 541–50 |
| [4] | Rotmistrovsky, K., Jang, W., Schuler, G.D. A web server for performing electronic PCR. Nucleic Acids Res. 2004, 32 pp. 108–12 |
| [5] | Uhlig, S., Frost, K., Colson, B., Simon, K., Mäde, D., Reiting, R., Gowik, P., Grohmann, L. Validation of qualitative PCR methods on the basis of mathematical-statistical modelling of the probability of detection. Accred. Qual. Assur. 2015, 20, pp. 75–83 |
| [6] | ISO 5725-2, Accuracy (trueness and precision) of measurement methods and results — 2: Basic method for the determination of repeatability and reproducibility of a standard measurement method |