ISO/TS 22690:2021 ゲノミクス情報学—ハイスループット遺伝子発現データの信頼性評価基準 | ページ 4

※一部、英文及び仏文を自動翻訳した日本語訳を使用しています。

1 スコープ

この文書は、ハイスループットの遺伝子発現データの信頼性評価基準を指定します。

これは、マイクロアレイ、次世代シーケンス、およびその他の形式のハイスループット技術から生成される遺伝子発現データの精度、再現性、比較可能性の評価に適用できます。

この文書では、RNA の次世代シーケンス (RNA-seq) のプロセスの品質関連データを特定します。この文書でカバーされるシーケンス プラットフォームは、ショートリード シーケンサーに限定されています。変異検出およびウイルス同定のための RNA-seq の使用は、この文書の範囲外です。

この文書は、ヒト、細胞株、前臨床動物などのヒトの健康に関連する種に適用されます。他の生物種は、この文書の範囲外です。

生物学的な観点から、遺伝子、転写物、アイソフォーム、エクソン、ジャンクションを含むすべての遺伝子配列の発現プロファイルは、この文書の範囲内です。

1 Scope

This document specifies reliability assessment criteria for high-throughput gene-expression data.

It is applicable to assessing the accuracy, reproducibility, and comparability of gene-expression data that are generated from microarray, next-generation sequencing, and other forms of high-throughput technologies.

This document identifies the quality-related data for the process of the next-generation sequencing of RNA (RNA-seq). The sequencing platform covered by this document is limited to short-read sequencers. The use of RNA-seq for mutation detection and virus identification is outside of the scope of this document.

This document is applicable to human health associated species such as human, cell lines, and preclinical animals. Other biological species are outside the scope of this document.

From a biological point of view, expression profiles of all genetic sequences including genes, transcripts, isoforms, exons, and junctions are within the scope of this document