ISO 17601:2016 土壌の質 — 土壌から直接抽出されたDNAからの定量的PCRによる選択された微生物遺伝子配列の存在量の推定 | ページ 4

※一部、英文及び仏文を自動翻訳した日本語訳を使用しています。

1 スコープ

この国際規格は、土壌 DNA 抽出物から選択された微生物遺伝子配列の存在量を測定し、選択された微生物グループの推定値を提供する定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応 (qPCR) 法の重要なステップを規定しています。

遺伝子の数が測定される生物の数に必ずしも直接関係しているわけではないことは注目に値します。たとえば、リボソームオペロンの数は、異なる細菌門では 1 コピーから 20 コピーまでの範囲にあります。したがって、土壌 DNA 抽出物から定量化された 16S rRNA 配列の数は、土壌細菌の数の正確な推定値を与えません。さらに、配列の数は必ずしも生きている微生物に関連しているわけではなく、死んだ微生物から増幅された配列を含む場合もあります。

1 Scope

This International Standard specifies the crucial steps of a quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) method to measure the abundance of selected microbial gene sequences from soil DNA extract which provides an estimation of selected microbial groups.

It is noteworthy that the number of genes is not necessarily directly linked to the number of organisms that are measured. For example, the number of ribosomal operon is ranging from one copy to 20 copies in different bacterial phyla. Therefore, the number of 16S rRNA sequences quantified from soil DNA extracts does not give an exact estimate of the number of soil bacteria. Furthermore, the number of sequences is not necessarily linked to living microorganisms and can comprise sequences amplified from dead microorganisms.